Les élèves marcheprimais âgés de 10 à 17 ans peuvent poursuivre leur scolarité dans deux établissements de l’enseignement secondaire : le collège Gaston Flament de Marcheprime et le lycée de la Mer de Gujan-Mestras.
Le collège est un établissement public faisant parti de l’académie de Bordeaux. Il ne propose pas d’internat.
L’origine de son nom : Gaston Flament fut enseignant à l’école de Croix d’Hins en 1965 puis à l’école du bourg de Marcheprime à partir de 1978. Il fut également directeur de l’école de 1978 à 1982, année de sa retraite. En 1969, il est devenu le quatrième maire de Marcheprime et le resta durant 26 ans, avant de se retirer pour raisons de santé. Il est décédé en 1998.
Le Lycée polyvalent de la Mer est composé de deux bâtiments :
Il s’agit d’un établissement polyvalent public situé à Gujan-Mestras et faisant partie de l’académie de Bordeaux. A noter qu’il propose les sections ULIS, européenne et théâtre. Il offre également la possibilité de suivre des spécialités peu proposées par d’autres établissements comme les spécialités numérique et sciences informatiques, sciences de l’ingénieur, llcer anglais. Enfin, il dispose d’une restauration pour les élèves et d’un internat.
Cet établissement bénéficie des labels suivants :